SK Mengkabong terletak di sebuah perkampungan nelayan kira-kira 5 km jauhnya dari Pekan Tuaran. sekolah ini terletak di atas sebuah bukit di tengah-tengah kampung tersebut. sejarah penubuhan sekolah bermula pada tahun 1959.
1930an -pertambahan penduduk mencecah 1000 orang menyebabkan sekolah perlu diubuhkan
15 Ogos 1939- Goverment Primary School(GPS) Mengkabong ditubuhkan. hanya mempunyai 1 bilik darjah sahaja dengan bilangan murid seramai 33 orang yang kesemuanya lelaki. mengajar kemahiran 3m dengan murid diantara umur 10-13 tahun dengan tenaga pengajar 3 orang termasuk Guru Besar Tuan Awang Matusin.
1963- bangunan sekolah ditambah kepada 3.
1976-bangunan sekolah yang baru dibina di atas bukit yang sama siap akhir tahun 1980.
1981-bangunan baru siap sepenuhnya di bawah Guru Besar Tuan hj. Abbas Hj. Ariffin.
1990- sekolah ini mempunyai 1 bilik pejabat Am dan bilik Guru Besar, 8 buah bilik darjah, 1 pusat sumber, 1bilik pemulihan khas, 1 bilik rehat guru, 2 tandas,2 stor untuk pendidikan jasmani. bilangan murid 537 orang dengan seorang guru besar, seorang penolong kanan I, penolong kanan HEM, penolong Kanan KOKUM dan seorang penyelia petang. terda[pat seramai 33 orang tenaga pengajar dan 7 orang kakitangan bukan mengajar.
sekolah ini mempunyai 2 sidang iaitu sidang pagi untuk murid Tahap 2 dan sidang petang untuk murid Tahap 1.